Secara tidak langsung Rektor membantu Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia di bidang yang menjadi tugas kewajibannya, selain kedudukannya selaku pimpinan Universitas Advent Indonesia. Dalam melaksanakan tugas sehari-hari, Rektor dibantu oleh 3 (tiga) orang Wakil Rektor yang berada dibawah dan bertanggung jawab langsung kepada Rektor, yaitu Wakil Rektor 1 Bidang Akademik, Wakil Rektor 2 Bidang Keuangan, dan Wakil Rektor 3 Bidang Kemahasiswaan.